在事业单位企业化管理过程中，管理者可能会面临各种困难和挑战，如机构惯性、员工思维定式、绩效考核不透明等。针对这些问题，可以采取以下措施来解决：
制定明确的目标和规划：明确企业化管理的目标，制定长期规划和短期目标，为整个过程提供指引和依据。
强化组织架构和流程优化：建立适应企业化管理的组织结构和流程，明确各部门职责和协作关系，提高工作效率和执行力。
建立绩效考核机制：建立科学、公平、透明的绩效考核机制，激励员工积极工作，提高整体绩效水平。
加强员工培训和激励：通过培训提升员工技能和素质，激励员工提高工作积极性和创造力。
推行信息化管理系统：引入信息化管理系统，提高管理效率和数据精准性，为决策提供科学依据。
建立沟通机制：加强内部沟通和协作，解决组织内部信息不畅、沟通不畅的问题，提高工作效率。
以某事业单位企业化管理过程中的一个案例为例：某医院在实行企业化管理过程中遇到了机构惯性强、员工抵触情绪重的问题。医院领导制定了明确的管理目标和规划，优化了组织架构和流程，建立了绩效考核机制，并加强了员工培训和激励措施。通过这些措施的实施，医院逐渐改变了原有的管理模式，提升了服务质量和管理效率，取得了显著的成效。
综上所述，事业单位企业化管理过程中的困难和挑战有解决方法，关键在于明确目标、优化组织、建立绩效考核、加强培训和沟通，通过这些措施可以有效应对和解决问题，推动企业化管理的顺利实施。